上海美高学校高中部的基础课程是指先于AP课程的学科基础课程。一般来说，学生必须通过基础课程后，才可以修读要求较高的AP课程。9至10年级的学业以基础课程为主，只有少量的AP课程可供程度较好的学生修读。
基础课程包括英语能力提升、文学导论、几何学、代数学、综合科学、物理、化学等。这些课程为11、12年级的高难度的AP课程建立完整的知识体系。而AP课程则需学生发挥自己的学科优势，发展特长，因而选择的空间也比较大。
高中部的基础课程全部采用美国本土教材，内容原汁原味，并且强调知识性、系统性。通常为学科领域中的通识。除了世界语言课程外，基础课程均以英语教学为主，少数情况下使用汉语教学。所以，双语老师能帮助高中低年级的学生逐渐克服语言障碍，向全英语授课过渡。
基础课程在强调学科性的同时，也突出学生综合能力的培养，比如：进一步提高英语听说能、演讲水平，以及写报告做报告的能力等。学生能在较短的时间内熟悉美国课程教学的标准流程，逐渐培养起学习国际课程必备的能力素养，为将来的学习打下扎实的基础。
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